Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms