Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJB4Q9UDY4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms