Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPASTQ9UBP0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms