Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRPC4Q9UBN4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms