Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTRRQ9UBK8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTRRQ9UBK8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTRRQ9UBK8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms