Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms