Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms