Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAPAQ9P0L0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms