Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNIH4Q9P003 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNIH4Q9P003 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNIH4Q9P003 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNIH4Q9P003 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNIH4Q9P003 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNIH4Q9P003 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNIH4Q9P003 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNIH4Q9P003 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNIH4Q9P003 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNIH4Q9P003 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNIH4Q9P003 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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