Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MSRB1Q9NZV6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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