Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NINJ2Q9NZG7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NINJ2Q9NZG7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms