Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDE1Q9NZC3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDE1Q9NZC3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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