Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY72

SCN3B, Sodium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3BQ9NY72 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN3BQ9NY72 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN3BQ9NY72 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms