Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A1Q9NY26 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms