Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIN1Q9NXP7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms