Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDIT4Q9NX09 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDIT4Q9NX09 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDIT4Q9NX09 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDIT4Q9NX09 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDIT4Q9NX09 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDIT4Q9NX09 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DDIT4Q9NX09 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDIT4Q9NX09 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDIT4Q9NX09 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDIT4Q9NX09 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT4Q9NX09 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT4Q9NX09 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT4Q9NX09 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT4Q9NX09 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT4Q9NX09 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDIT4Q9NX09 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms