Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL11Q9NVR0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL11Q9NVR0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms