Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IMP3Q9NV31 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP3Q9NV31 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms