Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDP1Q9NUW8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDP1Q9NUW8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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