Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATG3Q9NT62 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATG3Q9NT62 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms