Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms