Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SNTG1Q9NSN8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNTG1Q9NSN8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms