Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SALL1Q9NSC2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SALL1Q9NSC2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms