Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3GQ9NS98 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA3GQ9NS98 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3GQ9NS98 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3GQ9NS98 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms