Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPANXA1Q9NS26 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXA1Q9NS26 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXA1Q9NS26 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXA1Q9NS26 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXA1Q9NS26 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXA1Q9NS26 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXA1Q9NS26 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXA1Q9NS26 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXA1Q9NS26 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXA1Q9NS26 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXA1Q9NS26 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPANXA1Q9NS26 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPANXA1Q9NS26 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPANXA1Q9NS26 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPANXA1Q9NS26 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPANXA1Q9NS26 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPANXA1Q9NS26 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPANXA1Q9NS26 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms