Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNNM1Q9NRU3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CNNM1Q9NRU3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNNM1Q9NRU3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNNM1Q9NRU3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CNNM1Q9NRU3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNNM1Q9NRU3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNNM1Q9NRU3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNNM1Q9NRU3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNNM1Q9NRU3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNNM1Q9NRU3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNNM1Q9NRU3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNNM1Q9NRU3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNNM1Q9NRU3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNNM1Q9NRU3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNNM1Q9NRU3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNNM1Q9NRU3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms