Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBQLN4Q9NRR5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBQLN4Q9NRR5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBQLN4Q9NRR5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBQLN4Q9NRR5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBQLN4Q9NRR5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBQLN4Q9NRR5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBQLN4Q9NRR5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBQLN4Q9NRR5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBQLN4Q9NRR5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBQLN4Q9NRR5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBQLN4Q9NRR5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBQLN4Q9NRR5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBQLN4Q9NRR5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBQLN4Q9NRR5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBQLN4Q9NRR5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBQLN4Q9NRR5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBQLN4Q9NRR5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBQLN4Q9NRR5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBQLN4Q9NRR5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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