Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF3Q9NR23 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms