Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQQ7

SLC35C2, Solute carrier family 35 member C2, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C2Q9NQQ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C2Q9NQQ7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C2Q9NQQ7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C2Q9NQQ7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C2Q9NQQ7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C2Q9NQQ7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C2Q9NQQ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C2Q9NQQ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C2Q9NQQ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C2Q9NQQ7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C2Q9NQQ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C2Q9NQQ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C2Q9NQQ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C2Q9NQQ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C2Q9NQQ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C2Q9NQQ7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C2Q9NQQ7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms