Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms