Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD3

EXOSC4, Exosome complex component RRP41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC4Q9NPD3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC4Q9NPD3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC4Q9NPD3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC4Q9NPD3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC4Q9NPD3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC4Q9NPD3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC4Q9NPD3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC4Q9NPD3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC4Q9NPD3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EXOSC4Q9NPD3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC4Q9NPD3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC4Q9NPD3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC4Q9NPD3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC4Q9NPD3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC4Q9NPD3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC4Q9NPD3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC4Q9NPD3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC4Q9NPD3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC4Q9NPD3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC4Q9NPD3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC4Q9NPD3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC4Q9NPD3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC4Q9NPD3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC4Q9NPD3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms