Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMG20AQ9NP66 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMG20AQ9NP66 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms