Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRM3Q9NNZ6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms