Protein–RNA interactions for Protein: Q9N2J8

HERV-H_2q24.1 provirus ancestral Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9N2J8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9N2J8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9N2J8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9N2J8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9N2J8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9N2J8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9N2J8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9N2J8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9N2J8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9N2J8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9N2J8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9N2J8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9N2J8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9N2J8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9N2J8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9N2J8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9N2J8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9N2J8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9N2J8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9N2J8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9N2J8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9N2J8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9N2J8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9N2J8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9N2J8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9N2J8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9N2J8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9N2J8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9N2J8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9N2J8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9N2J8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9N2J8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9N2J8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9N2J8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9N2J8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9N2J8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9N2J8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9N2J8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9N2J8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9N2J8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9N2J8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9N2J8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9N2J8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9N2J8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9N2J8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9N2J8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9N2J8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9N2J8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9N2J8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9N2J8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9N2J8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9N2J8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9N2J8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9N2J8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9N2J8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9N2J8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9N2J8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9N2J8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9N2J8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9N2J8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9N2J8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9N2J8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9N2J8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9N2J8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9N2J8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9N2J8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9N2J8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9N2J8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9N2J8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9N2J8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9N2J8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9N2J8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9N2J8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9N2J8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9N2J8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9N2J8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9N2J8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9N2J8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9N2J8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9N2J8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9N2J8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9N2J8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9N2J8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9N2J8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9N2J8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9N2J8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9N2J8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9N2J8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9N2J8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9N2J8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9N2J8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9N2J8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9N2J8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9N2J8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9N2J8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9N2J8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9N2J8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9N2J8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9N2J8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9N2J8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms