Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRMS1Q9HCU9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BRMS1Q9HCU9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms