Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms