Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POPDC2Q9HBU9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms