Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM27Q9HBJ8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms