Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1BQ9H9Y6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.4 ms