Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COG4Q9H9E3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms