Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXO5Q9H790 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EXO5Q9H790 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXO5Q9H790 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXO5Q9H790 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms