Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RETREG1Q9H6L5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RETREG1Q9H6L5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms