Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.7 ms