Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM38AQ9H6F2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms