Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RWDD1Q9H446 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RWDD1Q9H446 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RWDD1Q9H446 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms