Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINC00597Q9H2U6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms