Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms