Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED28Q9H204 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MED28Q9H204 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MED28Q9H204 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MED28Q9H204 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MED28Q9H204 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MED28Q9H204 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MED28Q9H204 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MED28Q9H204 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MED28Q9H204 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms