Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK2Q9H0K1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms