Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NYXQ9GZU5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NYXQ9GZU5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NYXQ9GZU5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms